RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 RORCP51449 518 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLDN12P56749 244 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAMTQ14353 236 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 P2RY14Q15391 338 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 VWC2Q2TAL6 325 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 AARDQ4LEZ3 155 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM201AQ5SY85 155 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 IDNKQ5T6J7 187 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 HES5Q5TA89 166 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 DDI2Q5TDH0 399 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP43Q70EL4 1123 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR86Q86TI4 376 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 LYPD6Q86Y78 171 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF573Q86YE8 665 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CALHM1Q8IU99 346 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDH26Q8IXH8 852 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 MKXQ8IYA7 352 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 BATF2Q8N1L9 274 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR4D6Q8NGJ1 314 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OCC1Q8TAD7 63 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAB2BQ8WUD1 216 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQP3Q92482 292 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 THRSPQ92748 146 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RDH5Q92781 318 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A28Q96A46 364 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPSB1Q96BD6 273 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ISOC1Q96CN7 298 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEH1LQ96EE3 360 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 C5orf30Q96GV9 206 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF488Q96MN9 340 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCSTAMPQ9H295 470 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCB9Q9NP78 766 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 BATF3Q9NR55 127 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF7Q9UBF6 113 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CACNG2Q9Y698 323 aa4.49□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 DSCAMO60469 2012 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0B4J203 849 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0G2JK05 382 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAGE12BA1L429 117 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRP5LA4QPB2 252 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5B21A6NL26 309 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM210A6NLX4 147 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM157AC9JC47 383 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 F8VVB4 439 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 F8VWA3 439 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC22A1O15245 554 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 AKR7A2O43488 359 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A17O43808 307 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 LHBP01229 141 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV1D-12P01611 117 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 SFTPBP07988 381 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 DAOP14920 347 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 BCL3P20749 454 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 HTR2CP28335 458 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR3A4PP47883 348 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPBWR2P48146 333 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPOXP50336 477 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 EFNA4P52798 201 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZP1P60852 638 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF154Q13106 437 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAB11BQ15907 218 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARTPTQ16568 116 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR10K2Q6IF99 312 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM166AQ6J272 317 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR82Q6UXN9 313 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASCL4Q6XD76 172 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 CADM3Q8N126 398 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.48□□□□□ -1.69
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms