RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPACA1Q9HBV2 294 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCAF16Q9NXF7 216 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC39A1Q9NY26 324 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSPB8Q9UJY1 196 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HHLA3Q9XRX5 114 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USF3Q68DE3 2245 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RFX7Q2KHR2 1363 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM170AA1A519 330 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM235A6NFC5 223 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM212A6NML5 194 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A8MWP6 167 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIRO00625 290 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PHYHO14832 338 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MED7O43513 233 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCF21O43680 179 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC37A4O43826 429 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RDH16O75452 317 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MT1BP07438 61 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GUSBP08236 651 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HLA-GP17693 338 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NT5EP21589 574 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRTN3P24158 256 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GNA11P29992 359 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SRIP30626 198 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSD17B2P37059 387 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LPAR6P43657 344 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT2P50583 147 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RND2P52198 227 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKR1C2P52895 323 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ROMO1P60602 79 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKR1C1Q04828 323 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HHATQ5VTY9 493 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IYDQ6PHW0 289 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UNC93AQ86WB7 457 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BBS5Q8N3I7 341 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBAC2Q8NBM4 344 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR4M2Q8NGB6 313 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR1F12Q8NHA8 337 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC29Q8WV35 223 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAL2Q969L2 176 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPACA5Q96QH8 159 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SH3GL1Q99961 368 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DOHHQ9BU89 302 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFFQ9GZY8 342 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MTFP1Q9UDX5 166 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABCB11O95342 1321 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPTBP11277 2137 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMIM9A6NGZ8 99 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HMSDA8MTL9 139 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H0YAA0 97 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDC80O14777 642 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MT-ND3P03897 115 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHBGP04278 402 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CRYGDP07320 174 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAGEA2P43356 314 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBXW4P57775 412 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FGF12P61328 243 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLRB1Q12918 225 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAB31Q13636 194 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ITIH4Q14624 930 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF846Q147U1 533 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC36A3Q495N2 470 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WDR88Q6ZMY6 472 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RTL4Q6ZR62 310 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GALNT10Q86SR1 603 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LHFPL1Q86WI0 220 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NIT1Q86X76 327 aa-1.64□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms