RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TAAR9Q96RI9 348 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPH5 198 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TRDCB7Z8K6 153 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf24Q7Z6I8 188 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ABHD3Q8WU67 409 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf1Q9H5F2 150 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 K7N7A8 449 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-9P01782 118 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 OR13C7P0DN81 318 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SRPXP78539 464 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 S100A12P80511 92 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D26Q86UD7 250 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM185AQ8N0U4 392 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SPSB4Q96A44 273 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RFNGQ9Y644 331 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS44E7EML9 344 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CBR1P16152 277 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SPIN3Q5JUX0 258 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 DPPA2Q7Z7J5 298 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF695Q8IW36 515 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1J1Q8NGS3 322 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 EXTL1Q92935 676 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CFIP05156 583 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SULT1A1P50225 295 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PMS2CLQ68D20 193 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM56Q96MV1 263 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ARG1P05089 322 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 OMGP23515 440 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF266Q14584 549 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM24BQ8N5W8 94 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 LFNGQ8NES3 379 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RARRES2Q99969 163 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPE3 182 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 IGSF23A1L1A6 192 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC3CA6NJW4 275 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2CO00762 179 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR37O15354 613 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB5AP20339 215 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2G3Q8NGZ4 309 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PR64 198 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PRV1 198 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TK1P04183 234 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RHEBQ15382 184 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 Q8NFD4 153 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 GPHA2Q96T91 129 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PRDM14Q9GZV8 571 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V0CP27449 155 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 Q0VFX4 171 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 POM121Q96HA1 1249 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGT1Q9H0U3 335 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SCTP09683 121 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 BCL3P20749 454 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC23A3Q6PIS1 610 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 COL6A3P12111 3177 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GW64 132 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF724A8MTY0 619 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PROB1E7EW31 1015 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SSSCA1O60232 199 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS18P62269 152 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL20P78556 96 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZS49 121 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 GAPTQ8N292 157 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 Q9N2K0 584 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 DEPPQ9NTK1 212 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 NCKAP5O14513 1909 aa23.27■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNOP22674 350 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 SOHLH1Q5JUK2 328 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM252Q8N6L7 170 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF565Q8N9K5 539 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms