RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	TRAM1	Q15629	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		Q8N7P7	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPK0	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		M0R1W7	72 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SH2D1B	O14796	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CPE	P16870	476 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PTGFR	P43088	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MAP2K4	P45985	399 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR3A4P	P47883	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	KLRD1	Q13241	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	BLMH	Q13867	455 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	RSU1	Q15404	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SNX22	Q96L94	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	S100A13	Q99584	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MGLL	Q99685	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MMP27	Q9H306	513 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		M0QZ24	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PIN1P1	O15428	100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SC5D	O75845	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MAS1	P04201	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CALCB	P10092	127 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GABRR1	P24046	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	DUSP1	P28562	367 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PNKD	Q8N490	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRD5	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRF3	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRM7	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TIMM23	O14925	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR2H2	O95918	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF44	P15621	663 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	EDDM3B	P56851	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	INSL4	Q14641	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GRK1	Q15835	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	SIRPB1	O00241	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MGST3	O14880	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	PSPN	O60542	156 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CDRT1	O95170	752 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GABRA5	P31644	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	GPR176	Q14439	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	AWAT2	Q6E213	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148		Q8NFD4	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-223	ENST00000508148	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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