RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SNX22Q96L94 193 aa11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPH5 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC160A6NGH7 325 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 J3QLI3 93 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 AIPO00170 330 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR3A1P47881 315 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 MPV17LQ2QL34 196 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.08□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00596Q86U02 117 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 BPIFB2Q8N4F0 458 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 FCN3O75636 299 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ALDH3B2P48448 385 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB12Q6IQ22 244 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A28Q96A46 364 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 SPACA1Q9HBV2 294 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 hADV38S2A0JD32 116 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 TOX4O94842 621 aa11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 UNC119Q13432 240 aa11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8NFD4 153 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 Q96M66 194 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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