RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	DYNLT3	P51808	116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZP1	P60852	638 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	KISS1	Q15726	138 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		Q96MT0	163 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MMP28	Q9H239	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PRX2	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ODAM	A1E959	279 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SULT1B1	O43704	296 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	NFYB	P25208	207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LMO1	P25800	156 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PTGFR	P43088	359 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SOX2	P48431	317 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CORO2A	Q92828	525 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		H0YJX3	145 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TOR1A	O14656	332 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MPZL2	O60487	215 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB40B	Q12829	278 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	STMN2	Q93045	179 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GPER1	Q99527	375 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GABRP	O00591	440 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BAG2	O95816	211 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GLP1R	P43220	463 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR3A4P	P47883	348 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MTNR1B	P49286	362 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BDH1	Q02338	343 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LTC4S	Q16873	150 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ALX3	O95076	343 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CSN2	P05814	226 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB3A	P20336	220 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BRS3	P32247	399 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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