RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, human

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RERE-215	ENST00000492766	CCL3L1	P16619	93 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	GAL	P22466	123 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	DLX6	P56179	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	P2RX3	P56373	397 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	GPR176	Q14439	515 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	COQ2	Q96H96	371 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	SLC6A7	Q99884	636 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	BANF2	Q9H503	90 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	ATR	Q13535	2644 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	SLC17A2	O00624	439 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	MGMT	P16455	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	MYL9	P24844	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	HTR2C	P28335	458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	KLRD1	Q13241	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	LHX4	Q969G2	390 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766		Q96M66	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	BPNT1	O95861	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	UBB	P0CG47	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	GADD45A	P24522	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR10A3	P58181	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	AES	Q08117	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	UNC119	Q13432	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	P2RY14	Q15391	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	TAF9	Q16594	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	CST11	Q9H112	138 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RERE-215	ENST00000492766	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766		A0A1W2PPH5	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	ODAM	A1E959	279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	MPIG6B	O95866	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	CD36	P16671	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	PRTN3	P24158	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	GLIPR1	P48060	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	QRFP	P83859	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	BLMH	Q13867	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	RAB11B	Q15907	218 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RERE-215	ENST00000492766	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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