RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SPSB4Q96A44 273 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR51B6Q9H340 312 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 TMEM100Q9NV29 134 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 STARD10Q9Y365 291 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 XRCC2O43543 280 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.07□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.07□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.06□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF728P0DKX0 622 aa11.05□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 S100A12P80511 92 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MALLQ13021 153 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.05□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 LYL1P12980 280 aa11.05□□□□□ -0.64
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PRAME-213ENST00000492657 DECR2Q9NUI1 292 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 IL36GQ9NZH8 169 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ARGFXA6NJG6 315 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HSPB6O14558 160 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR5AC1P0C628 307 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 FUT3P21217 361 aa11.04□□□□□ -0.64
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