RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGC	Q92535	297 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		J3QT63	122 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TOX	O94900	526 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NAPSA	O96009	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA6	P05013	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR3A	P08637	254 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL2	P13500	99 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FUT3	P21217	361 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DNASE1	P24855	282 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	UCP2	P55851	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	UCP3	P55916	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	H2BFS	P57053	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1CB	P62140	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXF2	Q12947	444 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF9	Q16594	264 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8IYB0	196 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GAPT	Q8N292	157 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CA10	Q9NS85	328 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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