RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 J3QRE1 110 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 MMP23AO75900 390 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1D-12P01611 117 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 MNDAP41218 407 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 GLIPR1P48060 266 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 BDH1Q02338 343 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 GALEQ14376 348 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.18■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.17■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.17■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 CD33P20138 364 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 NFYBP25208 207 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PRX2 142 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 ALX3O95076 343 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 CD24P25063 80 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 MTNR1BP49286 362 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 FBLN7Q53RD9 439 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZS46 218 aa16.15■□□□□ 0.18
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ACTB-212ENST00000484841 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-212ENST00000484841 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 HSPB6O14558 160 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PIN1P1O15428 100 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RAB3AP20336 220 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CD34P28906 385 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR3A4PP47883 348 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ZNF691Q5VV52 312 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 Q6P435 159 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 MRAPQ8TCY5 172 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OOSP1A8MZH6 123 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 H0YJX3 145 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 M0QZK8 103 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR2F2O95006 317 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ZFPL1O95159 310 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 IGLV1-47P01700 117 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 LPLP06858 475 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 FAM106CPP0CH98 169 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 GLP1RP43220 463 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RAB40BQ12829 278 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 KLHL22Q53GT1 634 aa16.13■□□□□ 0.17
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