RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ADI1Q9BV57 179 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 HMG20AQ9NP66 347 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT84Q9NSB2 600 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 ODAMA1E959 279 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMB11A5LHX3 300 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 LY6LH3BQJ8 138 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 M0QZK8 103 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 TOR1AO14656 332 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT1C4O75897 302 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2H2O95918 312 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1D-12P01611 117 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2T7P0C7T2 308 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 CORO2AQ92828 525 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf35Q96D05 121 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 FUOMA2VDF0 154 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D1BO14796 132 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 FAM107AO95990 144 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 RFT1Q96AA3 541 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 CITED4Q96RK1 184 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 ING3Q9NXR8 418 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087X0M5 115 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GX30 115 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT19A8MXV4 375 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OOSP1A8MZH6 123 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 RAMP3O60896 148 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 KDM4BO94953 1096 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 CSN2P05814 226 aa7.43□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF20P17024 532 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 PRRX1P54821 245 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 SCN1BQ07699 218 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6AP1Q15904 470 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 TP53I3Q53FA7 332 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6P435 159 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 DRAM1Q8N682 238 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OR56B4Q8NH76 319 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 SPSB1Q96BD6 273 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 KIRREL1Q96J84 757 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 OPALINQ96PE5 141 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 SPACA5Q96QH8 159 aa7.43□□□□□ -1.22
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