RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 A0A0G2JK05 382 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 A0A0U1RQK1 487 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MEIOCA2RUB1 952 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PSPNO60542 156 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DUSP1P28562 367 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SAA4P35542 130 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IER3P46695 156 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 P2RX3P56373 397 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PAX5Q02548 391 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 EDDM3AQ14507 147 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IRF3Q14653 427 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DTX3Q8N9I9 347 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PHYHIPQ92561 330 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CORO2AQ92828 525 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DERL3Q96Q80 235 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IFT22Q9H7X7 185 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GHRLQ9UBU3 117 aa10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SIRPB1O00241 398 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GTF2F2P13984 249 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR3A1P47881 315 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DLX6P56179 175 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SCN1BQ07699 218 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF273Q14593 569 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MPV17LQ2QL34 196 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 Q6P435 159 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OSR2Q8N2R0 312 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 UFD1Q92890 307 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CNBD2Q96M20 576 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CHST6Q9GZX3 395 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNRD1Q9P1U0 126 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ING4Q9UNL4 249 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 POM121CA8CG34 1229 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 HTR3BO95264 441 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CCL3L1P16619 93 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 OR3A4PP47883 348 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 TPBGQ13641 420 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 ACSM3Q53FZ2 586 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 RTN4RL2Q86UN3 420 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 JAGN1Q8N5M9 183 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 C3orf56Q8N813 242 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 OR13C5Q8NGS8 318 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 SLITRK2Q9H156 845 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 PPA2Q9H2U2 334 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A10PA6NDY2 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A18PA6NE21 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A16PA6NEW6 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A7PA6NKC0 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A22PA8MWA6 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A12PA8MX19 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 DENRO43583 198 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 ARL6IP5O75915 188 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CLPXO76031 633 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CDRT1O95170 752 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A15PP0C7V4 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A13PP0C7W8 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A14PP0C7W9 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A24PP0C7X0 464 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 UBBP0CG47 229 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CALCBP10092 127 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 GABARAPL2P60520 117 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 KLRD1Q13241 179 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms