RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 OR2T7P0C7T2 308 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF20P17024 532 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HTR1FP30939 366 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PTGFRP43088 359 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 THBS3P49746 956 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GNG10P50151 68 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RAB25P57735 213 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ISL1P61371 349 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DEFB136Q30KP8 78 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LPCAT4Q643R3 524 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GID4Q8IVV7 300 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 Q8IYB0 196 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RFESDQ8TAC1 157 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF596Q8TC21 504 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 EME1Q96AY2 570 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NRBF2Q96F24 287 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ASCL2Q99929 193 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NEK6Q9HC98 313 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 AASSQ9UDR5 926 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 G3V2T6 193 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SULT1C4O75897 302 aa8.85□□□□□ -0.99
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ACTB-209ENST00000473257 ATP6V1E1P36543 226 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GLP1RP43220 463 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HES1Q14469 280 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 CDK5R1Q15078 307 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR52W1Q6IF63 320 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 UBALD1Q8TB05 177 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PP6455Q8WZ26 134 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 CORO2AQ92828 525 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TOMM40LQ969M1 308 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RAX2Q96IS3 184 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KIRREL1Q96J84 757 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OPALINQ96PE5 141 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PRR25Q96S07 402 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KIF25Q9UIL4 384 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPI3 338 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SERPINE3A8MV23 424 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 E9PQ18 207 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 H3BUI4 141 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DEGS1O15121 323 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KDM4BO94953 1096 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 FAM107AO95990 144 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PRKACBP22694 351 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 REG1BP48304 166 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ATP6AP1Q15904 470 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN26Q16670 478 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RPEQ96AT9 228 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 CALYQ9NYX4 217 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GLS2Q9UI32 602 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-209ENST00000473257 H0YHG0 523 aa8.83□□□□□ -1
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