RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	CHST4	Q8NCG5	386 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	DUX5	Q96PT3	197 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		14.56	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	hADV38S2	A0JD32	116 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	FUOM	A2VDF0	154 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRIM77	I1YAP6	450 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SRM	P19623	302 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PRTN3	P24158	256 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	LMO1	P25800	156 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	AES	Q08117	197 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GPR176	Q14439	515 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	CDH26	Q8IXH8	852 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	IL36G	Q9NZH8	169 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	LRRC42	Q9Y546	428 aa		14.55	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF728	P0DKX0	622 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GTF2F2	P13984	249 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PSMB9	P28065	219 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GABRA5	P31644	462 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	P2RX3	P56373	397 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ERVFRD-1	P60508	538 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	IL13RA2	Q14627	380 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SPART	Q8N0X7	666 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PNKD	Q8N490	385 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PHYHIP	Q92561	330 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF714	Q96N38	554 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ESM1	Q9NQ30	184 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	FBN3	Q75N90	2809 aa		14.54	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A0U1RQK1	487 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PP11	408 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	NPFF	O15130	113 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SC5D	O75845	299 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	ARL6IP5	O75915	188 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	UCHL1	P09936	223 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	COX7A1	P24310	79 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	GLIPR1	P48060	266 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	FABP5	Q01469	135 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902		Q8NFD4	153 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF14	Q92956	283 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
USP19-210	ENST00000465902	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MEIOC	A2RUB1	952 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBE2E1	P51965	193 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SSX1	Q16384	188 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZNF773	Q6PK81	442 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	FCGR1B	Q92637	280 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	BANF2	Q9H503	90 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		14.52	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	C17orf98	A8MV24	154 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PAH	P00439	452 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TAF9	Q16594	264 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	LINC00596	Q86U02	117 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	NEK7	Q8TDX7	302 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	FAM46B	Q96A09	425 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		14.51	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ODAM	A1E959	279 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CCRL2	O00421	344 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CSN2	P05814	226 aa		14.5	□□□□□ -0.09

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