RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRR1P24046 479 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 COX7A1P24310 79 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CRHBPP24387 322 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 BDKRB2P30411 391 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFBR2P37173 567 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 VHLP40337 213 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGFRP43088 359 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 IER3P46695 156 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFB3P59826 476 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTG1P63261 375 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN1BQ07699 218 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM1Q08AH1 577 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB2A2Q13296 93 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GRK1Q15835 563 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 Q499Y3 187 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FBLN7Q53RD9 439 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 DDI2Q5TDH0 399 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RNLSQ5VYX0 342 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8IYB0 196 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1-206ENST00000461017 PXT1Q8NFP0 134 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CNBD2Q96M20 576 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 DERL3Q96Q80 235 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 JMJD8Q96S16 334 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 PPA2Q9H2U2 334 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK6Q9HC98 313 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ING3Q9NXR8 418 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 C1RLQ9NZP8 487 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ING4Q9UNL4 249 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM172BPA6NC97 362 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ODF3BA8MYP8 253 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YHG0 523 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB6O14558 160 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MGST3O14880 152 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MYL12BO14950 172 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 DEGS1O15121 323 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SC5DO75845 299 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CYB5AP00167 134 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MAS1P04201 325 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF44P15621 663 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FSTP19883 344 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MTNR1BP49286 362 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPK1Q13546 671 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ELP2Q6IA86 826 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO2AQ92828 525 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MUL1Q969V5 352 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GPER1Q99527 375 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GFI1Q99684 422 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 VCXQ9H320 206 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK15Q9H427 330 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR137BO60478 399 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CD2P06729 351 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA2P20848 420 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB13P51153 203 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RX3P56373 397 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R43P59537 309 aa5.67□□□□□ -1.5
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