RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 RBP4P02753 201 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2F2P13984 249 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2E1P51965 193 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 DLX6P56179 175 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 P2RX3P56373 397 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS25P62851 125 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SCN1BQ07699 218 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF273Q14593 569 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00596Q86U02 117 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FCGR1BQ92637 280 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MUL1Q969V5 352 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLITRK2Q9H156 845 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT22Q9H7X7 185 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF212BA8MTL3 300 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM77I1YAP6 450 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF728P0DKX0 622 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL3L1P16619 93 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNJ3P48549 501 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 EDDM3AQ14507 147 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SSX1Q16384 188 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MPV17LQ2QL34 196 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD21Q4G0X4 260 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF773Q6PK81 442 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC22Q8N966 263 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CORO2AQ92828 525 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN34H7C241 214 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINA2P20848 420 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GALP22466 123 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVFRD-1P60508 538 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FABP5Q01469 135 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PAX5Q02548 391 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGYQ3MUY2 71 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 AWAT2Q6E213 333 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HCP5Q6MZN7 132 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF714Q96N38 554 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PPA2Q9H2U2 334 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ESM1Q9NQ30 184 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ATRQ13535 2644 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 UBBP0CG47 229 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 AESQ08117 197 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 BAMBIQ13145 260 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6YL49 198 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TCF23Q7RTU1 214 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TPRX1Q8N7U7 411 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 BARHL1Q9BZE3 327 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PP11 408 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ODAMA1E959 279 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BUI4 141 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CCRL2O00421 344 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 NPFFO15130 113 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GLIPR1P48060 266 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMD7P51665 324 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DLX1P56177 255 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MIDNQ504T8 468 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 COQ2Q96H96 371 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6C3Q9NZP0 311 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A10PA6NDY2 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A18PA6NE21 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A16PA6NEW6 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms