RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MPV17LQ2QL34 196 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 PRO1933Q9H354 126 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM157AC9JC47 383 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 IFNA17P01571 189 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 IGLV3-19P01714 112 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 LYL1P12980 280 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 BCO1Q9HAY6 547 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CACNA1GO43497 2377 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 BMP5P22003 454 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CARD18P57730 90 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RND3P61587 244 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 NABP1Q96AH0 204 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 STARD10Q9Y365 291 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 AP4M1O00189 453 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 S100PP25815 95 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 EXTL1Q92935 676 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CHST1O43916 411 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 HEXAP06865 529 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP9P14780 707 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 DLK1P80370 383 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 PSG4Q00888 419 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RSG1Q9BU20 258 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SPTBN2O15020 2390 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MPPED1O15442 326 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCL1P22362 96 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF429Q86V71 674 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP250Q9BV73 2442 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 S100A8P05109 93 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SEC11BP0C7V7 166 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SRFP11831 508 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 BCL3P20749 454 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ARL6IP1Q15041 203 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 V9GYS6 101 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TRGC2P03986 189 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 TK1P04183 234 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CD63P08962 238 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CXCL1P09341 107 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM6P0DI80 62 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 GLRX2Q9NS18 164 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-202ENST00000440289 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 SSR4P51571 173 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 TM2D1Q9BX74 207 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 CALHM2Q9HA72 323 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A0U1RQV5 110 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 HSPA12AO43301 675 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXB1Q99853 325 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRJ-202ENST00000440289 HSF4Q9ULV5 492 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms