RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 IL13RA2Q14627 380 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 PIGYQ3MUY2 71 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TCF23Q7RTU1 214 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 CDH26Q8IXH8 852 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 PNKDQ8N490 385 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 MGLLQ99685 303 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.75□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 SC5DO75845 299 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF728P0DKX0 622 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 CPEP16870 476 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 UBE2E1P51965 193 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 HCP5Q6MZN7 132 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 OSR2Q8N2R0 312 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF714Q96N38 554 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.74□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PP11 408 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 FUOMA2VDF0 154 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 MEGF11A6BM72 1044 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 C17orf98A8MV24 154 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 HSPB6O14558 160 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 AESQ08117 197 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TRAM1Q15629 374 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 AWAT2Q6E213 333 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 Q6YL49 198 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 LYPD6Q86Y78 171 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 MEIOCA2RUB1 952 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 CLDN34H7C241 214 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 CSN2P05814 226 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 MELTFP08582 738 aa14.72□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 SAA4P35542 130 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 GLIPR1P48060 266 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ACTG1P63261 375 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 GPR176Q14439 515 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 SVOPQ8N4V2 548 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 PHYHIPQ92561 330 aa14.72□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.72□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 RBP4P02753 201 aa14.71□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 SRMP19623 302 aa14.71□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.71□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-205ENST00000426683 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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HERC3-205ENST00000426683 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 FBP1P09467 338 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GABRA5P31644 462 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 FABP5Q01469 135 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 SSX1Q16384 188 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 LINC00596Q86U02 117 aa14.7□□□□□ -0.06
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