RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR13Q9NZ81 148 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 NTF3P20783 257 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF320A2RRD8 509 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 TO15178 435 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 IL11P20809 199 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR3DL2P43630 455 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 MPV17LQ2QL34 196 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 LIAT1Q6ZQX7 453 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5A2Q8NGI9 324 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 RND1Q92730 232 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 UPK3AO75631 287 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 RBP4P02753 201 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 TTRP02766 147 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 CXCL3P19876 107 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 EFNB2P52799 333 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 ZP3P21754 424 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM33P57088 247 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 PRRX1P54821 245 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 SPINK9Q5DT21 86 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 MISP3Q96FF7 219 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS44E7EML9 344 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 PPYP01298 95 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 HPXP02790 462 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF561Q8N587 486 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB1BQ9H0U4 201 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGYQ3MUY2 71 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM27BQ5VT28 67 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A40Q8TBP6 338 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OOEPA6NGQ2 149 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB1CQ92928 201 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 TMPRSS2O15393 492 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CRHP06850 196 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF5P12034 268 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 BTNL3Q6UXE8 466 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A42Q86VD7 318 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM10Q96HG1 83 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CD1AP06126 327 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 IFI6P09912 130 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4S2Q8NH73 311 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SAP25Q8TEE9 199 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ANGPTL4Q9BY76 406 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CSF2RBP32927 897 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 PMELP40967 661 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 GAPTQ8N292 157 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SVILO95425 2214 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 DBX1A6NMT0 343 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 LANCL1O43813 399 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX15O60248 233 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 VDAC1P21796 283 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVFC1-1P60608 527 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5I1Q13606 314 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MDP1Q86V88 176 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 M0QZ24 198 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF205O95201 554 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM3AP98173 230 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CKAP5Q14008 2032 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OPN1MWP04001 364 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 GZMHP20718 246 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 IL24Q13007 206 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF24Q9Y225 148 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNGR2O43760 224 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD34CP0C6C1 535 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 Q56UQ5 140 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PN81 502 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNA7P36544 502 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-201ENST00000418331 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 309.7 ms