RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404040.5

HDAC11-204, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HDAC11, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDAC11-204ENST00000404040 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC11-204ENST00000404040 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC11-204ENST00000404040 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.65□□□□□ -0.06
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HDAC11-204ENST00000404040 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 AIREO43918 545 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 CD37P11049 281 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 PSG2P11465 335 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 GADD45AP24522 165 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 HERPUD1Q15011 391 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 AWAT2Q6E213 333 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 REC114Q7Z4M0 266 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 GPR141Q7Z602 305 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 OR51E2Q9H255 320 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 HMG20AQ9NP66 347 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DUX4Q9UBX2 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 V9GY05 133 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC11-204ENST00000404040 IGKV1D-12P01611 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 CHRM2P08172 466 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC11-204ENST00000404040 PRKACAP17612 351 aa14.62□□□□□ -0.07
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