RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 CDK1P06493 297 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL3L1P16619 93 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CELP19835 753 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FSTP19883 344 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DUSP1P28562 367 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RANBP1P43487 201 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR3A1P47881 315 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RAG2P55895 527 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PAX5Q02548 391 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SCN1BQ07699 218 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 KLRD1Q13241 179 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 EDDM3AQ14507 147 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF273Q14593 569 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 XAF1Q6GPH4 301 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 HCP5Q6MZN7 132 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6P435 159 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 BATF2Q8N1L9 274 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PNKDQ8N490 385 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 IFT22Q9H7X7 185 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.93□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRD5 423 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRF3 423 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRM7 423 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ODAMA1E959 279 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGES3LE9PB15 166 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 GABRPO00591 440 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CLPXO76031 633 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR3BO95264 441 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 LALBAP00709 142 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 MYF6P23409 242 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNLT3P51808 116 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGDIBP52566 201 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 AQP4P55087 323 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DOC2BQ14184 412 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SPHARQ15513 63 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DDI2Q5TDH0 399 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF626Q68DY1 528 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf88Q6PI97 169 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OSR2Q8N2R0 312 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 NRG4Q8WWG1 115 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PHYHIPQ92561 330 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SSX3Q99909 188 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 CHST6Q9GZX3 395 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 DUSP21Q9H596 190 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf95Q9H693 158 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB9BQ9NP90 201 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 C1RLQ9NZP8 487 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ING4Q9UNL4 249 aa6.92□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 ODF3BA8MYP8 253 aa6.91□□□□□ -1.3
MT-TS1-201ENST00000387416 RGS10O43665 173 aa6.91□□□□□ -1.3
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