RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABRA4P48169 554 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZCWPW2Q504Y3 356 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLYATQ6IB77 296 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LAIR2Q6ISS4 152 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERICH5Q6P6B1 374 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 NELFCDQ8IXH7 590 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 KATNAL2Q8IYT4 538 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM58AQ8N1B3 248 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR11G2Q8NGC1 345 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPB2Q96IY4 423 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADTRPQ96IZ2 230 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPZA3Q96KX2 299 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSPB9Q9BQS6 159 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXO5Q9H790 373 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf4Q9NQ89 552 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNIP2Q9NS61 270 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDIT4Q9NX09 232 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC22A14Q9Y267 594 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIA3Q5JRA6 1907 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PXDNLA1KZ92 1463 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPXA8MT69 81 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35B1P78383 322 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFFO1Q0D2I5 559 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEACAM21Q3KPI0 293 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q499Y3 187 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLCXD3Q63HM9 321 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCH3Q86UD3 253 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP4Z1Q86W10 505 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 NIT1Q86X76 327 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A45Q8N413 288 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR51A7Q8NH64 312 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMBLQ96DG6 245 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OLFM3Q96PB7 478 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANXA10Q9UJ72 324 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00588Q9Y4M8 146 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PRF3 423 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PRM7 423 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 M0R1B8 84 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A20O43772 301 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R60P59551 318 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL31P62899 125 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN2P80188 198 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 BEX3Q00994 111 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOFQ13790 326 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTBL2Q562R1 376 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 NXNL2Q5VZ03 156 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ULK3Q6PHR2 472 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 COMMD1Q8N668 190 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCP10LQ8TDR4 215 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 FMC1Q96HJ9 113 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC01587Q99440 93 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRB1P82279 1406 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OTOFQ9HC10 1997 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUPT3HB4E1H0 165 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAPSAO96009 420 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 CECR9P0C854 216 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 M6PRP20645 277 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB25P57735 213 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V1FQ16864 119 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52K1Q8NGK4 314 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4X1Q8NH49 305 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCL2L14Q9BZR8 327 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 POMKQ9H5K3 350 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM131Q92545 1883 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRCAMQ92823 1304 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCTP09848 1927 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRGV2A0A075B6R0 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0G2JQZ4 141 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MWP6 167 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 EVI2BP34910 448 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 XKP51811 444 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUPD1Q68J44 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELP2Q6IA86 826 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 C16orf87Q6PH81 154 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35D2Q76EJ3 337 aa0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms