RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 OR4S1Q8NGB4 309 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PPP1R35Q8TAP8 253 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SNAPC3Q92966 411 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF286AQ9HBT8 521 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.64■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 NAPSAO96009 420 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF224P0DH78 156 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SPNP16150 400 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 GIFP27352 417 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 VAX1Q5SQQ9 334 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 C11orf71Q6IPW1 123 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 Q6ZS49 121 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5H2Q8NGV7 314 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.63■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HSPB6O14558 160 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNA6P05013 189 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 FCER2P06734 321 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 DANCRP0C864 163 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PSG2P11465 335 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PRDX2P32119 198 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TEX36Q5VZQ5 186 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52W1Q6IF63 320 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 MOB1BQ7L9L4 216 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PRRT1Q99946 306 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.62■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OOEPA6NGQ2 149 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 AMY2AP04746 511 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HRH1P35367 487 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR3A3P47888 321 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 BPIFB2Q8N4F0 458 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ARRDC1Q8N5I2 433 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5AP2Q8NGF4 316 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 DYRK2Q92630 601 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC2A8Q9NY64 477 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ANXA10Q9UJ72 324 aa20.61■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ARPC4P59998 168 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM165Q9HC07 324 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM221AA4D161 298 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 C3orf80F5H4A9 247 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM178BH3BS89 294 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 M0QYG6 137 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TCRBP04435 133 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CD80P33681 288 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 KIR2DS4P43632 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 COL10A1Q03692 680 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 KIR2DS1Q14954 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HFEQ30201 348 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM17Q86X19 198 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 GAPTQ8N292 157 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR4D10Q8NGI6 311 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 UBTD1Q9HAC8 227 aa20.6■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 LGALS8O00214 317 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CSN2P05814 226 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SOD3P08294 240 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CCR6P51684 374 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PAX5Q02548 391 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 TLE4Q04727 773 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 STUMQ69YW2 141 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR51S1Q8NGJ8 323 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 OR56B4Q8NH76 319 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ANGPTL6Q8NI99 470 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CCL17Q92583 94 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CYYR1Q96J86 154 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 MMP28Q9H239 520 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 PPA2Q9H2U2 334 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF222Q9UK12 451 aa20.59■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CD8AP01732 235 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HPXP02790 462 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 RAG2P55895 527 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 CDK10Q15131 360 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNJ8Q15842 424 aa20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms