RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 OCEL1Q9H607 264 aa24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ST3GAL6Q9Y274 331 aa24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 NOTCH2Q04721 2471 aa24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC168Q8NDH2 2452 aa24.7■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ORC5O43913 435 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ECDO95905 644 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GDNFP39905 211 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ8Q15842 424 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZNX1 250 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM5Q8N4H5 51 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ANGPTL6Q8NI99 470 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GPX8Q8TED1 209 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 DEDD2Q8WXF8 326 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 RAB3CQ96E17 227 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 MTFP1Q9UDX5 166 aa24.69■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 LPLP06858 475 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GSTT2BP0CG30 244 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 AP3S2P59780 193 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF146Q15072 292 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM155Q4W5P6 130 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 NHLRC3Q5JS37 347 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 SPIN3Q5JUX0 258 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CHST4Q8NCG5 386 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 Q96MF0 132 aa24.68■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 SOCS1O15524 211 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GABRA2P47869 451 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM50BP56557 158 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 DYRK1AQ13627 763 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CDNFQ49AH0 187 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R8Q9NYW2 309 aa24.68■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 MEIOCA2RUB1 952 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A10PA6NDY2 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A18PA6NE21 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A16PA6NEW6 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A7PA6NKC0 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A22PA8MWA6 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A12PA8MX19 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa24.67■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A15PP0C7V4 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A13PP0C7W8 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A14PP0C7W9 464 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A24PP0C7X0 464 aa24.67■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A16P16260 332 aa24.67■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 LYPD2Q6UXB3 125 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZTK2 550 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CD177Q8N6Q3 437 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CCL13Q99616 98 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF222Q9UK12 451 aa24.67■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CEACAM18A8MTB9 384 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 LYRM1O43325 122 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 PRDX2P32119 198 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 PDCD1Q15116 288 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 GDPD3Q7L5L3 318 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 SPICQ8N5J4 248 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC11Q8NEX6 87 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 COX4I2Q96KJ9 171 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 KLK11Q9UBX7 282 aa24.66■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 MFNGO00587 321 aa24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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ECHS1-201ENST00000368547 HAND1O96004 215 aa24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TAF9Q16594 264 aa24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 GLS2Q9UI32 602 aa24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 HSF4Q9ULV5 492 aa24.65■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM235A6NFC5 223 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 TMPRSS2O15393 492 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 CA11O75493 328 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 RFX2P48378 723 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ACTBP60709 375 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ACTG1P63261 375 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 IL13RA2Q14627 380 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF788Q6ZQV5 615 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB10Q9UN67 800 aa24.64■■□□□ 1.54
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa24.64■■□□□ 1.53
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