RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHDHQ9UQ10 334 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF879B4DU55 563 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTGES3LE9PB15 166 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 INMTO95050 263 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NXPH2O95156 264 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGKV1D-12P01611 117 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIPFP07098 398 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SFTPBP07988 381 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 BCL3P20749 454 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRKACBP22694 351 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDX2P32119 198 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPBWR2P48146 333 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX2P48431 317 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTCP1P56278 107 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 CAV3P56539 151 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT4P56705 351 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 LOXL3P58215 753 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNLSQ5VYX0 342 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR148Q8TDV2 347 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFT1Q96AA3 541 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEP19Q96LK0 163 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OPALINQ96PE5 141 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPACA5Q96QH8 159 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBX15Q96SF7 602 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC6A7Q99884 636 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIRPDQ9H106 197 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF69Q9UC07 566 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP50Q9UKX7 468 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANK2Q01484 3957 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYL12BO14950 172 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCF21O43680 179 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SULT1B1O43704 296 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANGPTL7O43827 346 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 VENTXO95231 258 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFB7P17568 137 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 VHLP40337 213 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPA13P48723 471 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 POU3F4P49335 361 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZP1P60852 638 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARF6P62330 175 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35A2P78381 396 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRF3Q14653 427 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 MKXQ8IYA7 352 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF561Q8N587 486 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q8N7P7 452 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 GHSRQ92847 366 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYDGFQ969H8 173 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM106AQ96A25 262 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ORAI1Q96D31 301 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDFY2Q96P53 400 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCN3BQ9NY72 215 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00473A8K010 186 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF737O75373 536 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 KDM4BO94953 1096 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU1-38P-201ENST00000362817 TK1P04183 234 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms