RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR2L13Q8N349 312 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 NKD1Q969G9 470 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASL10BQ96S79 203 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB18Q9NP72 206 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABI3Q9P2A4 366 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 PROB1E7EW31 1015 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 LILRA1O75019 489 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT-CO2P00403 227 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1D-16P01601 117 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLC2P0DOY2 106 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLC3P0DOY3 106 aa9.44□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.44□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.44□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.44□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.43□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 CKLFQ9UBR5 152 aa9.43□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF83P51522 516 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 CKS1BP61024 79 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADIPOQQ15848 244 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM177Q53S58 311 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR7Q8TB68 274 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA1456Q9P272 454 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSG11Q9UQ72 335 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.43□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A8P0DMV1 189 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A9P0DMV2 189 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL11P20809 199 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPOP30536 169 aa9.42□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 GABRA2P47869 451 aa9.42□□□□□ -0.9
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ADIRFQ15847 76 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 HLA-BQ31612 363 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYS1Q8N2H4 156 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF128Q8TEB7 428 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 KXD1Q9BQD3 176 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDAC8Q9BY41 377 aa9.42□□□□□ -0.9
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
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