RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 NUP37Q8NFH4 326 aa11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 NTNG2Q96CW9 530 aa11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RAB40CQ96S21 281 aa11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RNF2Q99496 336 aa11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.15□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 MMP24Q9Y5R2 645 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 A0A1W2PN81 502 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 C9orf170A2RU37 121 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CAMPP49913 170 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SLC25A1P53007 311 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 PMS2P11Q13670 270 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 WDR90Q96KV7 1748 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RREB1Q92766 1687 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM127O75204 238 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 PSMB2P49721 201 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RAB32Q13637 225 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 NTN1O95631 604 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 OR5AC1P0C628 307 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TNXAQ16473 311 aa11.14□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 J3KRW8 73 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 AMER3Q8N944 861 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 PRO1933Q9H354 126 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC190Q86UF4 302 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 MS4A10Q96PG2 267 aa11.13□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 KCNK17Q96T54 332 aa11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 IL20Q9NYY1 176 aa11.13□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 CTF1Q16619 201 aa11.12□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 PRSS12P56730 875 aa11.12□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 LINC01560Q8TB33 94 aa11.12□□□□□ -0.63
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XIRP1-201ENST00000340369 hADV38S2A0JD32 116 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CTAG2O75638 210 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 OR3A1P47881 315 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 FDX2Q6P4F2 183 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CLDN34H7C241 214 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CSN3P07498 182 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 KLK13Q9UKR3 277 aa11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
XIRP1-201ENST00000340369 SLC6A1P30531 599 aa11.12□□□□□ -0.63
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