RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF488Q96MN9 340 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 SYT3Q9BQG1 590 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 LRFN1Q9P244 771 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 MPPED1O15442 326 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 GLAP06280 429 aa21.79■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 HPSE2Q8WWQ2 592 aa21.79■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 NEK7Q8TDX7 302 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 SPACA1Q9HBV2 294 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa21.78■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1-13P0DP09 117 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 RGCCQ9H4X1 137 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 C19orf12Q9NSK7 152 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 PLA2G3Q9NZ20 509 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 IL36GQ9NZH8 169 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 TDGF1P13385 188 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 P2RY1P47900 373 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB3-201ENST00000311626 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa21.77■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 FAM213BQ8TBF2 198 aa21.77■■□□□ 1.08
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HOXB3-201ENST00000311626 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa21.76■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 OR4D5Q8NGN0 318 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 LYPD6BQ8NI32 183 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 GINS3Q9BRX5 216 aa21.76■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 MTCH1Q9NZJ7 389 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 IGSF23A1L1A6 192 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF732B4DXR9 585 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 OR13C7P0DN81 318 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 AWAT1Q58HT5 328 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 VASH2Q86V25 355 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF695Q8IW36 515 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 ADAM20O43506 726 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 SEC11BP0C7V7 166 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 GNMTQ14749 295 aa21.74■■□□□ 1.07
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HOXB3-201ENST00000311626 RARRES2Q99969 163 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 CCL28Q9NRJ3 127 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 POMT1Q9Y6A1 747 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 PQLC2LA1A4F0 135 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 TRDCB7Z8K6 153 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 IL13RA2Q14627 380 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 GPR157Q5UAW9 335 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB3-201ENST00000311626 PRO3102Q9H379 93 aa21.74■■□□□ 1.07
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