RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 OOEPA6NGQ2 149 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 LGALS8O00214 317 aa15.17■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 CD80P33681 288 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 FAM25CB3EWG5 89 aa15.17■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 FAM25GB3EWG6 89 aa15.17■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 PPIAL4DF5H284 164 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.15■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.15■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.15■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 H3BUI4 141 aa15.15■□□□□ 0.02
PTX4-201ENST00000293922 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF205O95201 554 aa15.15■□□□□ 0.02
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PTX4-201ENST00000293922 GATA3P23771 443 aa15.14■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 LMO1P25800 156 aa15.14■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 CHATP28329 748 aa15.14■□□□□ 0.01
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PTX4-201ENST00000293922 PRDX2P32119 198 aa15.14■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MNDAP41218 407 aa15.14■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 IKZF1Q13422 519 aa15.14■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 LSAMPQ13449 338 aa15.14■□□□□ 0.01
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