RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ST8SIA4Q92187 359 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SARAFQ96BY9 339 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CMBLQ96DG6 245 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGMQ9H3S5 423 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RASL12Q9NYN1 266 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR132Q9UNW8 380 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C6A6NF89 314 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MFNGO00587 321 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SOCS1O15524 211 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 XRCC2O43543 280 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX5O60225 188 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA5P05154 406 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL3P10147 92 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A1P11166 492 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 DTYMKP23919 212 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PMELP40967 661 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR3A4PP47883 348 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP1B3P54709 279 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RSU1Q15404 277 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MICBQ29980 383 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52W1Q6IF63 320 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 AAED1Q7RTV5 226 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM123Q8N131 208 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BVESQ8NE79 360 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 DCUN1D4Q92564 292 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NTNG2Q96CW9 530 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BORCS8Q96FH0 119 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf50Q96LR7 162 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PECRQ9BY49 303 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 REG4Q9BYZ8 158 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BANF2Q9H503 90 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 EHFQ9NZC4 300 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 HSF4Q9ULV5 492 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A6YYD4 124 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YW62 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF222A6NCQ9 220 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 DBX1A6NMT0 343 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF11O14788 317 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZIC3O60481 467 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 GOSR1O95249 250 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV1-40P01703 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LCATP04180 440 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM225BP0DP42 221 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF250P15622 560 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINF1P36955 418 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RBP2P50120 134 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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