RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 PROB1E7EW31 1015 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SSSCA1O60232 199 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 FBP1P09467 338 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 NTF4P34130 210 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 RBM11P57052 281 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 COL19A1Q14993 1142 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ODF3L1Q8IXM7 274 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TOLLIPQ9H0E2 274 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 GLRX2Q9NS18 164 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 LIPGQ9Y5X9 500 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CST2P09228 141 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF32P17041 273 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SRPXP78539 464 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 EXT1Q16394 746 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 GUSBP11Q6P575 273 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 BATF2Q8N1L9 274 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TMEM56Q96MV1 263 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CRLF2Q9HC73 371 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 P4HTMQ9NXG6 502 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 KIAA1456Q9P272 454 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 OR6C6A6NF89 314 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 H0YL77 283 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 FUT6P51993 359 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CEBPGP53567 150 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 RAB2AP61019 212 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF695Q8IW36 515 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF100Q8IYN0 542 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 OR5C1Q8NGR4 320 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF700Q9H0M5 742 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SLC7A10Q9NS82 523 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TMEM38BQ9NVV0 291 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DKKL1Q9UK85 242 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 BTBD17A6NE02 478 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CXCL1P09341 107 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 FUT3P21217 361 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 EPHA1P21709 976 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CCL7P80098 99 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF92Q03936 586 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ICAM4Q14773 271 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ELOBQ15370 118 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DPPA2Q7Z7J5 298 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CALHM1Q8IU99 346 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 Q8WTZ3 238 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SLC25A31Q9H0C2 315 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 A0A087WWC5 75 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF732B4DXR9 585 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ADAM20O43506 726 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 B4GALT1P15291 398 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DYNLT3P51808 116 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 UBE2KP61086 200 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PSG4Q00888 419 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DNASE2BQ8WZ79 361 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PIGCQ92535 297 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 GPHA2Q96T91 129 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 HSPA12AO43301 675 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CST7O76096 145 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TMEM50AO95807 157 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 NPBWR2P48146 333 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 NDUFA6P56556 154 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DLK1P80370 383 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 ZNF429Q86V71 674 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 FGFBP3Q8TAT2 258 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SPIN2AQ99865 258 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DOK5Q9P104 306 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 TTC28Q96AY4 2481 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 RAC1P63000 192 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-201ENST00000263233 VAMP2P63027 116 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms