RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R30P59541 319 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HLA-CQ95604 372 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CAPNS2Q96L46 248 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MS4A10Q96PG2 267 aa6.29□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 NAT8Q9UHE5 227 aa6.29□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 TBX21Q9UL17 535 aa6.29□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TNFSF12O43508 249 aa6.28□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 CDS2O95674 445 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H3AP68431 136 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF154Q13106 437 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PRSS8Q16651 343 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FAM57BQ71RH2 274 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.28□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.28□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TP53RKQ96S44 253 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 KCNK17Q96T54 332 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 P2RX4Q99571 388 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 Q9N2K0 584 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DMDP11532 3685 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 A0A0J9YY10 115 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C17orf105B2RV13 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TRDCB7Z8K6 153 aa6.28□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SHHQ15465 462 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 BSXQ3C1V8 233 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ATP5SQ99766 215 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TM2D1Q9BX74 207 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.28□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 MUC3AQ02505 3323 aa6.27□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SHISA7A6NL88 538 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 H0YIG0 161 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 NXPH3O95157 252 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 HRASP01112 189 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 IL12BP29460 328 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 MTCP1P56278 107 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 BAXQ07812 192 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CST9LP1Q5W188 147 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 DOK3Q7L591 496 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 DDAH2O95865 285 aa6.27□□□□□ -1.41
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