RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SHISA9B4DS77 424 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 IL13RA2Q14627 380 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MICBQ29980 383 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CD276Q5ZPR3 534 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR4K15Q8NH41 348 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CA10Q9NS85 328 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PLCE1Q9P212 2302 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DSCAMO60469 2012 aa14.73□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 UBE2QL1A1L167 161 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 H3BUI4 141 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PMP2P02689 132 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CSN2P05814 226 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DUSP1P28562 367 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PMELP40967 661 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CD200P41217 278 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MPPED2Q15777 294 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ACTBL2Q562R1 376 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 LINC00596Q86U02 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 POC1AQ8NBT0 407 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 BEST4Q8NFU0 473 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 NEUROG1Q92886 237 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FOXC2Q99958 501 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 GINS4Q9BRT9 223 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR51J1Q9H342 316 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.72□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 A0A0A6YYJ9 748 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 IL5P05113 134 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FCGR3AP08637 254 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 AMY2BP19961 511 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 IKZF1Q13422 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZFP69Q49AA0 526 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 Q6ZPA2 131 aa14.71□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.71□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 GHITMQ9H3K2 345 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 BEX1Q9HBH7 125 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HES4Q9HCC6 221 aa14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.71□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 DTYMKP23919 212 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 Q6P435 159 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 WDR82Q6UXN9 313 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC107Q8WV48 283 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 PRRT1Q99946 306 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 IFT22Q9H7X7 185 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.71□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 PLSCR5A0PG75 271 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 A6NLC8 198 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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SRSF1-201ENST00000258962 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ADIPOQQ15848 244 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SPRNQ5BIV9 151 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CHST6Q9GZX3 395 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.7□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 E7EQL1 145 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NXPH2O95156 264 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 IFNA6P05013 189 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GMFBP60983 142 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MZT1Q08AG7 82 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CBX3Q13185 183 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.69□□□□□ -0.06
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