RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PDZD9Q8IXQ8 264 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 OSR2Q8N2R0 312 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 BPIFB2Q8N4F0 458 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 NKAIN3Q8N8D7 197 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CHST4Q8NCG5 386 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D15Q8TC07 691 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 UQCC2Q9BRT2 126 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PRDM13Q9H4Q3 707 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.24■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 C17orf98A8MV24 154 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA2P20848 420 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 KLRD1Q13241 179 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 EDDM3AQ14507 147 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A6Q4U2R8 563 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC22Q8N966 263 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 COQ2Q96H96 371 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SUCNR1Q9BXA5 334 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PPA2Q9H2U2 334 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CSN2P05814 226 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 RBM11P57052 281 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 AESQ08117 197 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 IFT22Q9H7X7 185 aa18.23■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GLIPR1P48060 266 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 P2RX3P56373 397 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 DEFB112Q30KQ8 113 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 AWAT2Q6E213 333 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PNKDQ8N490 385 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TMEM104Q8NE00 496 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R35Q8TAP8 253 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 S100A13Q99584 98 aa18.22■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 DNHD1Q96M86 4753 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SHISA3A0PJX4 238 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CSTBP04080 98 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF728P0DKX0 622 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 GLT8D1Q68CQ7 371 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 FCGR1BQ92637 280 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 CORO2AQ92828 525 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A28Q96A46 364 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 LINC00312Q9Y6C7 94 aa18.21■□□□□ 0.51
SYF2-201ENST00000236273 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 hADV38S2A0JD32 116 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CCRL2O00421 344 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GTF2F2P13984 249 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 UBE2E1P51965 193 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 BLMHQ13867 455 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GPR176Q14439 515 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 TAF9Q16594 264 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 AJUBAQ96IF1 538 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CYYR1Q96J86 154 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 BANF2Q9H503 90 aa18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQK1 487 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPH5 198 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A1O15245 554 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ARL6IP5O75915 188 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CGB3P0DN86 165 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CGB7P0DN87 165 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 CALRP27797 417 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 PSMB9P28065 219 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 QRFPP83859 136 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 PAX5Q02548 391 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 SUMF2Q8NBJ7 301 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa18.19■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRD5 423 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRF3 423 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRM7 423 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 HSPB6O14558 160 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 MMP23AO75900 390 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 RBP4P02753 201 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 VSIG8P0DPA2 414 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GALP22466 123 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 MPV17LQ2QL34 196 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 NCR3LG1Q68D85 454 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 LINC00596Q86U02 117 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 Q96M66 194 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ZNF714Q96N38 554 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 GHRLQ9UBU3 117 aa18.18■□□□□ 0.5
SYF2-201ENST00000236273 ODAMA1E959 279 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms