RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029907.5

Ubxn2b-201, Transcript of UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn2b, Length 6,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Stard10Q9JMD3 291 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 NpffQ9WVA8 114 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 SncgQ9Z0F7 123 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rev3lQ61493 3122 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm10112D3YWP5 117 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Bcl2l11O54918 196 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 BidP70444 195 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pld6Q5SWZ9 221 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sema6dQ76KF0 1073 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr804Q7TRH7 314 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Asb13Q8VBX0 278 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1466Q8VFW4 310 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 St3gal6Q8VIB3 329 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 SigirrQ9JLZ8 409 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ca14Q9WVT6 337 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4931429L15RikE9PVU2 379 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Igk-V19-17P01633 149 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 MgmtP26187 211 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Galr1P56479 348 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr32Q7TQZ0 308 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sh2d7Q8BI17 458 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Frmd6Q8C0V9 622 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 C1ql2Q8CFR0 287 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gtf2f2Q8R0A0 249 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn1r37Q8R2E4 302 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr134Q8VG95 312 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Igsf6P0C6B7 237 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Id1P20067 168 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PilraQ2YFS3 302 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zfp729aQ4QQP3 973 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Calhm2Q8VEC4 323 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1241Q8VF91 314 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gpx8Q9D7B7 209 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1039A2ARY0 319 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm21981D3Z6Q6 369 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc17a3G3UWD9 498 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Phb2O35129 299 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nkain3Q3URJ8 181 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr331Q5NC44 324 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gpr89aQ8BS95 455 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Trib3Q8K4K2 354 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Prrt1O35449 306 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Defb4P82019 63 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tle3Q08122 772 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1442Q0VEV7 312 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mccc2Q3ULD5 563 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm6899Q3USS0 134 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Foxb1Q64732 325 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Depp1Q8K2F3 205 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr186Q8VEX5 309 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1451Q8VFX5 310 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sytl3Q99N48 607 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 CfdP03953 259 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Foxa3P35584 353 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tcf7Q00417 419 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Irgm1Q60766 409 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Actbl2Q8BFZ3 376 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 NrrosQ8BMT4 693 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr815Q8VFU0 316 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ctag2Q9D9S4 219 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rspo1Q9Z132 265 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gsx2P31316 305 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rpusd3Q14AI6 344 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmed3Q78IS1 221 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn1r183Q8K3N5 305 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mrgpra4Q91WW2 313 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmem50bQ9D1X9 158 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cml5Q9QXS8 227 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Frem2Q6NVD0 3160 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm5901D3YVJ1 333 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ca6P18761 317 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 GrnP28798 589 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1087Q7TR63 313 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1388Q8VFA3 311 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1201Q8VGF5 307 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Atp23Q9CWQ3 201 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Brca2P97929 3329 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm572B1ARY8 399 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm10097J3KMK7 105 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Foxl2O88470 375 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Timp1P12032 205 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rnase12Q5GAM8 145 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Prrg4Q8BGN6 226 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sec22aQ8BH47 307 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Comtd1Q8BIG7 262 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cpne4Q8BLR2 557 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Myct1Q8R411 188 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr1443Q8VFW8 312 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 SdhdQ9CXV1 159 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tex101Q9JMI7 250 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.9 ms