RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPE2 198 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PR64 198 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRV1 198 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SH2D1BO14796 132 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 NPFFO15130 113 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PSPNO60542 156 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GPX5O75715 221 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SMIM18P0DKX4 95 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CALCBP10092 127 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PPP3R1P63098 170 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ELP2Q6IA86 826 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 LDLRAD3Q86YD5 345 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 POMT1Q9Y6A1 747 aa20.36■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PTGES3LE9PB15 166 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GABRPO00591 440 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CCL3L1P16619 93 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GABRR1P24046 479 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 LMO1P25800 156 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 BMXP51813 675 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DLX6P56179 175 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 EDDM3BP56851 147 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SLC35A2P78381 396 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ACSM1Q08AH1 577 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DOC2BQ14184 412 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 HCP5Q6MZN7 132 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SATL1Q86VE3 508 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R35Q8TAP8 253 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GPER1Q99527 375 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MND1Q9BWT6 205 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DPPA5A6NC42 116 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MGST3O14880 152 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR2H2O95918 312 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 HKR1P10072 659 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CELP19835 753 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 MTNR1BP49286 362 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 GRK1Q15835 563 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ASCL4Q6XD76 172 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SSMEM1Q8WWF3 244 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CHST6Q9GZX3 395 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 C17orf98A8MV24 154 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 RBP4P02753 201 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 FBP1P09467 338 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 FSTP19883 344 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 BDKRB2P30411 391 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR3A1P47881 315 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 C16orf87Q6PH81 154 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 C12orf54Q6X4T0 127 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 CHST4Q8NCG5 386 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 Q8NFD4 153 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 OR4S1Q8NGB4 309 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 DUSP21Q9H596 190 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-220ENST00000618056 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNF728P0DKX0 622 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SAA4P35542 130 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 EDDM3AQ14507 147 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 DDI2Q5TDH0 399 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 Q6P435 159 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 TCF23Q7RTU1 214 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ORAI1Q96D31 301 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 OR14A2Q96R54 314 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CKLFQ9UBR5 152 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 hADV38S2A0JD32 116 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SIRPB1O00241 398 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 PTGFRP43088 359 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IER3P46695 156 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ERVFRD-1P60508 538 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IRF3Q14653 427 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 MIDNQ504T8 468 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 PNKDQ8N490 385 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SGCDQ92629 289 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 THRSPQ92748 146 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNRD1Q9P1U0 126 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRD5 423 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRF3 423 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRM7 423 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 MEIOCA2RUB1 952 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 DERL3Q96Q80 235 aa20.3■□□□□ 0.84
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