RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 EPOPA6NHQ4 379 aa17.77■□□□□ 0.44
CTDP1-208ENST00000613122 PAX5Q02548 391 aa17.77■□□□□ 0.44
CTDP1-208ENST00000613122 MDP1Q86V88 176 aa17.77■□□□□ 0.44
CTDP1-208ENST00000613122 NEU3Q9UQ49 428 aa17.77■□□□□ 0.44
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PRF1P14222 555 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 LPAR2Q9HBW0 351 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF320A2RRD8 509 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM210A6NLX4 147 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GZMHP20718 246 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZAR1Q86SH2 424 aa17.77■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SNCGO76070 127 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GPR27Q9NS67 375 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 J3QT63 122 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CDC20Q12834 499 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB37Q5TC79 503 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 BLNKQ8WV28 456 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC190Q86UF4 302 aa17.76■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SLC52A3Q9NQ40 469 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 WDR13Q9H1Z4 485 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 F5H697 171 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 DEFA6Q01524 100 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PJVKQ0ZLH3 352 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CTF1Q16619 201 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC2AQ6UVW9 174 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 R3HDM4Q96D70 268 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 NAGKQ9UJ70 344 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TGOLN2O43493 480 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 INSIG2Q9Y5U4 225 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SOX15O60248 233 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA7AO75326 666 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR5AC1P0C628 307 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 MESP2Q0VG99 397 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A22Q9H936 323 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 DOK5Q9P104 306 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 STARD10Q9Y365 291 aa17.75■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 MCM3APO60318 1980 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ADRB1P08588 477 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PMELP40967 661 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R1AQ13522 171 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 NHLRC2Q8NBF2 726 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 NPTNQ9Y639 398 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 POMT1Q9Y6A1 747 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ORM2P19652 201 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SAP25Q8TEE9 199 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 FGF5P12034 268 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC12BQ2HXU8 276 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GGNBP1Q5YKI7 109 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SLC24A4Q8NFF2 622 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 MSL2Q9HCI7 577 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 FOSL1P15407 271 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR5A2Q8NGI9 324 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR5C1Q8NGR4 320 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GPR137Q96N19 417 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GDF15Q99988 308 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PPQ1 181 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf170A2RU37 121 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A45Q8N413 288 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TMUB1Q9BVT8 246 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF716A6NP11 495 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PPIAL4DF5H284 164 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF586Q9NXT0 402 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS44E7EML9 344 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 GNG7O60262 68 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PDZD11Q5EBL8 140 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR4D11Q8NGI4 311 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 CST4P01036 141 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PLPPR5Q32ZL2 321 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf174Q8IYL3 243 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM251Q8N6I4 163 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR1B1Q8NGR6 318 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 OR10AC1Q8NH08 325 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 FOXL2P58012 376 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 DHRS2Q13268 280 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PCGF1Q9BSM1 259 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 RAB33BQ9H082 229 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDP1-208ENST00000613122 PLXNB2O15031 1838 aa17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms