RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0G2JK05 382 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 C22orf46C9J442 243 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 DEGS1O15121 323 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 PSPNO60542 156 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 BPNT1O95861 308 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR2H2O95918 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TK1P04183 234 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 RAB11BQ15907 218 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 PIGYQ3MUY2 71 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GPR141Q7Z602 305 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CHST4Q8NCG5 386 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 ST8SIA4Q92187 359 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 IFT22Q9H7X7 185 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 SCOCQ9UIL1 159 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 NOTOA8MTQ0 251 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 AIPO00170 330 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 ARSBP15848 533 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GATA3P23771 443 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 RANBP1P43487 201 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 PDCD1Q15116 288 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 P2RY14Q15391 338 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00596Q86U02 117 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 POM121Q96HA1 1249 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CST11Q9H112 138 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 BANF2Q9H503 90 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF44P15621 663 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 MGMTP16455 207 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 NDUFB7P17568 137 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TGFBR1P36897 503 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CLDN12P56749 244 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 PAX8Q06710 450 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 SCN1BQ07699 218 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 MPV17LQ2QL34 196 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 HES5Q5TA89 166 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GPR107Q5VW38 600 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR10K2Q6IF99 312 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR8H2Q8N162 312 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0G2JMP0 313 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0X1KG70 313 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 SIRPB1O00241 398 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 LDLRAD4O15165 306 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GABARAPO95166 117 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 LIPFP07098 398 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 GABRR1P24046 479 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 OR3A1P47881 315 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 MXD1Q05195 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 UNC119Q13432 240 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 TAF9Q16594 264 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 CTF1Q16619 201 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-204ENST00000594693 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms