RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 KRASP01116 189 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ORM1P02763 201 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 OR2B8PP59922 312 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 C17orf50Q8WW18 174 aa5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 TRDCB7Z8K6 153 aa5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 MPV17P39210 176 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 TXN2Q99757 166 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 JPT1Q9UK76 154 aa5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 OR1L1Q8NH94 360 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.45□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.44□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 MMDQ15546 238 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ATP6V1FQ16864 119 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ZG16BQ96DA0 208 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 TEX37Q96LM6 180 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 M0R1W7 72 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 DVL1O14640 695 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 CECR9P0C854 216 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ACKR3P25106 362 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 MGAT2Q10469 447 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 VWA1Q6PCB0 445 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 LHX4Q969G2 390 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ANK1P16157 1881 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.44□□□□□ -1.54
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SMAD4-212ENST00000591126 ST8SIA3O43173 380 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 AVPI1Q5T686 147 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 ACSM6Q6P461 480 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 GCM1Q9NP62 436 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 KPTNQ9Y664 436 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 OR5H14A6NHG9 310 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 NQO2P16083 231 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD4-212ENST00000591126 FMODQ06828 376 aa5.44□□□□□ -1.54
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