RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 COL7A1Q02388 2944 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKACAP17612 351 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK2P24941 298 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 POU3F4P49335 361 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf73Q69YU5 71 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN4RL2Q86UN3 420 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF596Q8TC21 504 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF286AQ9HBT8 521 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 HHLA2Q9UM44 414 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LEUTXA8MZ59 168 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRPB1O00241 398 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 APOL3O95236 402 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIC3O95833 236 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RBP2P50120 134 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FLOT2Q14254 428 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52W1Q6IF63 320 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HEPN1Q6WQI6 88 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV3LQ6ZN32 361 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GID4Q8IVV7 300 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL15A6NJ78 407 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZAR1LA6NP61 321 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA3P01011 423 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CD69Q07108 199 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf152Q5JTZ5 239 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH10Q8IZV5 341 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OSR2Q8N2R0 312 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAAF1Q8NEP3 725 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ADI1Q9BV57 179 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CD34P28906 385 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIPR1P48060 266 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGDIBP52566 201 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1B3P54709 279 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 UTF1Q5T230 341 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PP6455Q8WZ26 134 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO2AQ92828 525 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf35Q96D05 121 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT84Q9NSB2 600 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2H2O95918 312 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5AP00167 134 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR3DL2P43630 455 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MTCP1P56278 107 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42P60953 191 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 AESQ08117 197 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 B9D2Q9BPU9 175 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF649Q9BS31 505 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HMG20AQ9NP66 347 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R3Q9NYW6 316 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GLS2Q9UI32 602 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PQ18 207 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6LH3BQJ8 138 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1C4O75897 302 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-12P01611 117 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T7P0C7T2 308 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10H4Q8NGA5 316 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB11A5LHX3 300 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D1BO14796 132 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM3P40198 252 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZK1IP1Q13113 114 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF329Q86UD4 541 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DPF1Q92782 380 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RFT1Q96AA3 541 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 POMPQ9Y244 141 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QZK8 103 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC159P0C7I6 412 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF1P18846 271 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR1FP30939 366 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OR3A4PP47883 348 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 C18orf65Q6ZTR6 163 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF144BQ7Z419 303 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ2Q96H96 371 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR61Q9BZJ8 451 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.33■□□□□ 0.85
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