RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF32	P17041	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	GNMT	Q14749	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	RHEB	Q15382	184 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2C1	O95371	312 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	HERV-K104	P61576	105 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	HAGH	Q16775	308 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	YIF1A	O95070	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	LIF	P15018	202 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	HTR5A	P47898	357 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	NPBWR2	P48146	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF92	Q03936	586 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PIGC	Q92535	297 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	AP4M1	O00189	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SSSCA1	O60232	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	CST7	O76096	145 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PPY	P01298	95 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PMEL	P40967	661 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB5C	P51148	216 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RUNX1	Q01196	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB35	Q15286	201 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743		H0YL77	283 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	MPPED1	O15442	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TCN2	P20062	427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	GNRHR	P30968	328 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PI4KA	P42356	2102 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PDCD6	O75340	191 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	VAMP5	O95183	116 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	EPHA1	P21709	976 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	IGFBP4	P22692	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RND3	P61587	244 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	MALL	Q13021	153 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	NAT6	Q93015	286 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	HSPB6	O14558	160 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	PSG4	Q00888	419 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG16-205	ENST00000587743	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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