RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 OPRL1P41146 370 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC15A1P46059 708 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 HAAOP46952 286 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ISL1P61371 349 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 HES1Q14469 280 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT71Q3SY84 523 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 EME1Q96AY2 570 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 SNX22Q96L94 193 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ABHD6Q9BV23 337 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IFT27Q9BW83 186 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 GON7Q9BXV9 100 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CHST6Q9GZX3 395 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PKD1P98161 4303 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A087X0M5 115 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1B0GX30 115 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINA1P01009 418 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 APOC1P02654 83 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR8U9P0C7N5 309 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CLUP10909 449 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 MPZP25189 248 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR3DL2P43630 455 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PMS2P11Q13670 270 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 DGCR6Q14129 220 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 EBI3Q14213 229 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 GRK1Q15835 563 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR52W1Q6IF63 320 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 Q8N6K4 173 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2T4Q8NH00 348 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 36.3
SMARCE1-217ENST00000580654 TOMM40LQ969M1 308 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 KCTD7Q96MP8 289 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TMED9Q9BVK6 235 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 VSIG4Q9Y279 399 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A087WW49 117 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM120BA0PK00 339 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CXorf65A6NEN9 183 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 NUPR2A6NF83 97 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TOR1AO14656 332 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IDH3BO43837 385 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IGF1P05019 195 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 FMO3P31513 532 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 PRRX1P54821 245 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 IFI44LQ53G44 452 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM65Q6PI78 240 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2C3Q8N628 320 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF148Q8N7C7 305 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CORO2AQ92828 525 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 RPEQ96AT9 228 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR4C12Q96R67 309 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 MNTQ99583 582 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 OR51J1Q9H342 316 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 GHITMQ9H3K2 345 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR173Q9NS66 373 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 U3KQV3 271 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC01619G3V211 115 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 G3V318 75 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 B3GALNT1O75752 331 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-217ENST00000580654 TPPPO94811 219 aa5.84□□□□□ -1.47
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