RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPFF	O15130	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSPN	O60542	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPX5	O75715	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYF6	P23409	242 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	DUSP1	P28562	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	MTNR1B	P49286	362 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	DLX6	P56179	175 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPP3R1	P63098	170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	BDH1	Q02338	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIPK1	Q13546	671 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q499Y3	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	MIDN	Q504T8	468 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q8NFD4	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSNK1D-208	ENST00000578501	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MGST3	O14880	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2H2	O95918	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBP1	P09467	338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	GABRR1	P24046	479 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	IER3	P46695	156 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	HSPA13	P48723	471 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DLX1	P56177	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	EDDM3B	P56851	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOXL1	Q12952	345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLRD1	Q13241	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF273	Q14593	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRK1	Q15835	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	THRSP	Q92748	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	GABRP	O00591	440 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSN2	P05814	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CALCB	P10092	127 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCL3L1	P16619	93 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CEL	P19835	753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	FST	P19883	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	BDKRB2	P30411	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	SAA4	P35542	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTGFR	P43088	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR3A1	P47881	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC35A2	P78381	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q6P435	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPER1	Q99527	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEGS1	O15121	323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	P2RX3	P56373	397 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DOC2B	Q14184	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	RSU1	Q15404	277 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	DYRK2	Q92630	601 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A1W2PRD5	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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