RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 VGLL3A8MV65 326 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 H3BUX3 64 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM225BP0DP42 221 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 EDDM3AQ14507 147 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RCN1Q15293 331 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 C11orf88Q6PI97 169 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PXT1Q8NFP0 134 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 AJUBAQ96IF1 538 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.76□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TIMM23O14925 209 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PSPNO60542 156 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR2H2O95918 312 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 IGKV1D-12P01611 117 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CSN2P05814 226 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 COX7A1P24310 79 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 DUSP1P28562 367 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 MTNR1BP49286 362 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 P2RX3P56373 397 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CDK5R1Q15078 307 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF626Q68DY1 528 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ELP2Q6IA86 826 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR52W1Q6IF63 320 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF529Q6P280 563 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 Q6ZSV7 163 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR52N1Q8NH53 320 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RFT1Q96AA3 541 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM80Q96HE8 168 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SPACA5Q96QH8 159 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CITED1Q99966 193 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 VCXQ9H320 206 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.75□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ODF3BA8MYP8 253 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 H3BUI4 141 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OGG1O15527 345 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ALDOBP05062 364 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ARG1P05089 322 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR3A1P47881 315 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ETV1P50549 477 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PROK1P58294 105 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZP1P60852 638 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 BRICD5Q6PL45 260 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CORO2AQ92828 525 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CHST6Q9GZX3 395 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.74□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 DEGS1O15121 323 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF44P15621 663 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 C17orf50Q8WW18 174 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM106AQ96A25 262 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SMIM19Q96E16 107 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 GPER1Q99527 375 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PPA2Q9H2U2 334 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.73□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 A0A0G2JK05 382 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 M0QZ24 198 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SIRPB1O00241 398 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CLIC3O95833 236 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CAPGP40121 348 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 KIR2DS4P43632 304 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 DYNLT3P51808 116 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TAS2R43P59537 309 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PPP3R1P63098 170 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 Q6P435 159 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TREML4Q6UXN2 200 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TCF23Q7RTU1 214 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 Q8NFD4 153 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms