RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PP11	408 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		B9A039	149 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		F5H5P2	479 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		H0YL77	283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SPRY3	O43610	288 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SYNGR1	O43759	233 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZG16	O60844	167 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PDCD6	O75340	191 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CA11	O75493	328 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RAB3D	O95716	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MT-ND4	P03905	459 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GLA	P06280	429 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SFTPB	P07988	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MELTF	P08582	738 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF44	P15621	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GLRA1	P23415	457 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MPZ	P25189	248 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PMEL	P40967	661 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CD200	P41217	278 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TAS2R46	P59540	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ARPC4	P59998	168 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		M0R233	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MFNG	O00587	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PLA2G10	O15496	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MLNR	O43193	412 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	LANCL1	O43813	399 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CD3D	P04234	171 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PTHLH	P12272	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	GIF	P27352	417 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CHAT	P28329	748 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	NPBWR2	P48146	333 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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