RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 BANF2Q9H503 90 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RAB22AQ9UL26 194 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FLNCQ14315 2725 aa6.76□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A0A0A6YYD4 124 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM25AB3EWG3 89 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM25CB3EWG5 89 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM25GB3EWG6 89 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 H7C417 338 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 AKR7A2O43488 359 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GTF2F2P13984 249 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 EGR1P18146 543 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ETV6P41212 452 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FGF12P61328 243 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 Q8IYB0 196 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OSR2Q8N2R0 312 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LRRC29Q8WV35 223 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ERGIC1Q969X5 290 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TSC22D3Q99576 134 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GAL3ST1Q99999 423 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SOSTQ9BQB4 213 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NICN1Q9BSH3 213 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TM2D1Q9BX74 207 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RHOFQ9HBH0 211 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HES4Q9HCC6 221 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HMG20AQ9NP66 347 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DECR2Q9NUI1 292 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 V9GYH0 126 aa6.75□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SRRM5B3KS81 715 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RAB27BO00194 218 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 WNT9BO14905 357 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NXPH2O95156 264 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LHBP01229 141 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PRKACAP17612 351 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CPT2P23786 658 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CDK2P24941 298 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CDKN1AP38936 164 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PIGYQ3MUY2 71 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TREM2Q9NZC2 230 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RNF7Q9UBF6 113 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CACNG2Q9Y698 323 aa6.74□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A0A0A6YYH2 397 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A0A0G2JMP0 313 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A0A0X1KG70 313 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms