RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PLET1	Q6UQ28	207 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX31	Q8N9S9	440 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NDNF	Q8TB73	568 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SEH1L	Q96EE3	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT14	Q96FL9	552 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT9	Q9BW91	350 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CD84	Q9UIB8	345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	COL6A5	A8TX70	2615 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ATR	Q13535	2644 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NDX4	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPX	A8MT69	81 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF879	B4DU55	563 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		K7ERQ8	282 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CETN3	O15182	167 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RDH16	O75452	317 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV3-25	P01717	112 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IL32	P24001	234 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IVD	P26440	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	LCN1	P31025	176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CA7	P43166	264 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	GCLM	P48507	274 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK1A1	P48729	337 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOA	P61586	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1CB	P62140	327 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	QPRT	Q15274	297 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	HES5	Q5TA89	166 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TAC4	Q86UU9	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CBR4	Q8N4T8	237 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8N9W7	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CT55	Q8WUE5	264 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SGTB	Q96EQ0	304 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2M4	Q96R27	311 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ADA2	Q9NZK5	511 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP45	Q9UL16	551 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0D9SEW6	157 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRF3	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRM7	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	2.72	□□□□□ -1.97	7e-15	■■□□□ 12.5
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMPSTE24	O75844	475 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CD3G	P09693	182 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CD37	P11049	281 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ERG	P11308	486 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PRPS2	P11908	318 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB5A	P20339	215 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CYB561	P49447	251 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CCR6	P51684	374 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2E1	P51965	193 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	HERVK_113	P61574	105 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	DGCR6	Q14129	220 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PYCR3	Q53H96	274 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	THEM4	Q5T1C6	240 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL9	Q6T311	187 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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