RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 ARL11Q969Q4 196 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TMEM45BQ96B21 275 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 MISP3Q96FF7 219 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TMEM100Q9NV29 134 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CST2P09228 141 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 DDTP30046 118 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 DGCR2P98153 550 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 RAB40BQ12829 278 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 DOC2BQ14184 412 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 ZNF546Q86UE3 836 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.58□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 HHLA2Q9UM44 414 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PR64 198 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PRV1 198 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 C7orf66A4D0T2 115 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 PLA1AQ53H76 456 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 F5H5P2 479 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 HSPA12AO43301 675 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 SLC2A5P22732 501 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 GHSRQ92847 366 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 TIMD4Q96H15 378 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 UBBP0CG47 229 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 S100A7P31151 101 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 WNT4P56705 351 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 SYT9Q86SS6 491 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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GGA3-202ENST00000538886 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CBY3A6NI87 242 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 A6NNC1 897 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 BDKRB2P30411 391 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 ART1P52961 327 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 PDCD1Q15116 288 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 LTC4SQ16873 150 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-202ENST00000538886 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.56□□□□□ -1.2
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