RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	SNX22	Q96L94	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PRD5	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PRF3	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PRM7	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474		H3BUX3	64 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	HAND1	O96004	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MT-ND2	P03891	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	CCL3L1	P16619	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ATF1	P18846	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	COX7A1	P24310	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PEX2	P28328	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	GABRA5	P31644	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	BMX	P51813	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	EDDM3B	P56851	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	COL10A1	Q03692	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	GALE	Q14376	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF273	Q14593	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF146	Q15072	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	GRK1	Q15835	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474		Q6ZSV7	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PNKD	Q8N490	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	SSX3	Q99909	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	MMP27	Q9H306	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	ANK2	Q01484	3957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		F8VVB4	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		F8VWA3	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		H3BSH0	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		J3QLW9	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SH2D1B	O14796	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MGST3	O14880	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KDM4B	O94953	1096 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF19	P17023	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GABRB1	P18505	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms