RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 HES4Q9HCC6 221 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 AK3Q9UIJ7 227 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 SRRM5B3KS81 715 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 PSPNO60542 156 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 PFDN1O60925 122 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 GATA4P43694 442 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 AGAP6Q5VW22 663 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 Q6P435 159 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 GLCCI1Q86VQ1 547 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CD177Q8N6Q3 437 aa13.01□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 LHBP01229 141 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CD55P08174 381 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 GDNFP39905 211 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CAPZA1P52907 286 aa13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa13.01□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa13□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 GYPAP02724 150 aa13□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 ADH4P08319 380 aa13□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 PSG2P11465 335 aa13□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 NR4A2P43354 598 aa13□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 OR4D10Q8NGI6 311 aa13□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 DEGS1O15121 323 aa13□□□□□ -0.33
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TRPS1-206ENST00000517323 Q8IYB0 196 aa12.98□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.98□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CCL13Q99616 98 aa12.98□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC32Q9BV29 185 aa12.98□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 NARFLQ9H6Q4 476 aa12.98□□□□□ -0.33
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